內政部表示，「地方民意代表費用支給及村里長事務補助費補助條例」規定，村、里長事務補助費每月新台幣4萬5千元，是用於文具費、郵電費、水電費及其他因公支出。為避免村、里長未支應上開費用，內政部於2000年6月15日邀集地方政府召開研商會議，決議村、里長事務補助費得由地方政府先行提列一定比例為村、里辦公費，至於是否提列仍由地方政府自行規範。
內政部指出，有部分村、里長反映，事務補助費強制提列部分額度作為辦公費用，剩餘部分未歸還給村、里長使用並不合理，要求改善。經調查，全國僅基隆市、嘉義市及屏東縣3個地方政府有統一規範提列4千元做為村、里辦公費，內政部故邀集地方政府開會檢討，並決定不再引用2000年上開提列村、里辦公費的決議。至於依法應由村、里長事務補助費支應的費用，如村、里長未支付，可由地方政府自「次月」事務補助費中覈實扣抵，以回歸事務補助費的立法意旨，並已於本月11日函知各地方政府辦理。
內政部表示，對於媒體錯誤解讀內政部公文，導致民眾誤解村、里長自8月起加薪4千元，內政部除深表遺憾外，並再次強調村、里長事務補助費並非村、里長薪水，而是支應村、里長處理村、里事務之費用，請民眾切勿以訛傳訛。